(1) izbor opreme.Postoje određeni problemi u odabiru farmaceutske opreme, kao što su odabir prema iskustvu (bez stvarne kalkulacije, ili nedovoljna kalkulacija podataka), slijepa potraga za napredovanjem i nedovoljno istraživanje fizičkih podataka, koji ozbiljno utiču na praktičnost i ekonomičnost opreme.

(2) instalacija opreme i obuka.U procesu ugradnje farmaceutske opreme često se obraća pažnja na napredak izgradnje, zanemarujući kvalitet gradnje, što dovodi do povećanja troškova održavanja opreme u kasnijem periodu.Osim toga, neadekvatna obuka osoblja za održavanje i rad opreme također predstavlja rizik za upravljanje i održavanje farmaceutske opreme.

(3) nedovoljno ulaganja u upravljanje i održavanje informatizacije.Danas, iako mnoga preduzeća pridaju veliki značaj upravljanju i održavanju opreme, kao i vođenju evidencije o održavanju opreme i evidenciji osnovnih parametara i uradili neke, neki problemi i dalje postoje, kao što je teško obezbediti podatke o nastavku održavanja, nedostatak efektivnih informacije o specifikacijama farmaceutske opreme, kao što su specifikacije, crteži, itd., ovaj nevidljivi je povećao poteškoće u upravljanju opremom, održavanju i rekonstrukciji.

(4) sistem upravljanja.Nedostatak efikasnog sistema upravljanja i metoda, što rezultira nedostatkom upravljanja osobljem za održavanje farmaceutske opreme, nedostatak standardizacije rada osoblja za održavanje, upravljanje farmaceutskom opremom i proces održavanja ostavljajući sigurnosne skrivene opasnosti.